新云居山隧道群由5座隧道组成，全长4.5千米。具有“下穿上跨”“小间距”的特点，正线隧道全长1699.82米，在全线属于高风险隧道。
隧道工程水文地质条件复杂，有多处施工风险。不但上跨既有市政公路清凉山隧道（最小净距约为1.8米），而且下穿同样在建的动走1线新云居山三号隧道（最小净距约4.5米）；全线施工临近既有铁路和公路地段，安全风险极高，尤其是隧道进口段下方为既有福厦动车所，出口段下方约65米为G324国道，场地狭小，资源条件有限，因此进洞方式采用横洞、斜井两个辅助坑道；隧道进口段为隧道大跨段，隧道最大结构宽度达到了21米，隧道出口段与新云居山四号隧道为隧道小间距段，最小间距仅有1.13米。斜井与出口承担任务877米，占隧道全长52.5%。
经过大桥人攻坚克难，贯通日期比计划提前了7天。为实现快速化施工，项目部始终秉承打造“精品工程、智能福厦”的建设理念，派驻主要领导和技术骨干深入一线施工现场，围绕掌子面围岩情况及超前地质预报实地调研前方地质状况，严格控制现场施组工序，浅埋隧道施工严格遵循“管超前、严注浆、弱爆破、短进尺、早封闭、勤量测”的原则，施工计划精确到天，过程中采用轮流值班制度，不断加强围岩监控量测，采用信息化手段实时把控隧道拱顶沉降和收敛速率，严格标准化施工要求，实现了不塌方、少沉降的安全施工成效，为下一步隧道整体贯通、按节点施工奠定了坚实的基础。
福厦高速铁路建成后，将成为福建省内第一条真正意义上的高铁。铁路建成后，将缩短福州、厦门、泉州、漳州之间的时空距离，厦榕宁将形成1小时交通圈，厦漳泉将形成半小时交通圈，推进海西城市群快速发展。
